miR-200b-3p和miR-200b-5p在马立克氏病抗性与易感SPF鸡法氏囊组织的差异表达分析

doi:10.3969/j.issn.1674-5817.2017.03.015

实验动物与比较医学 ›› 2017, Vol. 37 ›› Issue (3): 244-248.DOI: 10.3969/j.issn.1674-5817.2017.03.015

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miR-200b-3p和miR-200b-5p在马立克氏病抗性与易感SPF鸡法氏囊组织的差异表达分析

王瑞琪^1,2, 廉传江², 易诚^1,2, 韩凌霞², 杨春文¹, 陈洪岩²

1.牡丹江师范学院生命科学与技术学院, 牡丹江 157011;
2.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室,实验动物与比较医学创新团队, 哈尔滨 150069

收稿日期:2016-11-23 出版日期:2017-06-25 发布日期:2017-06-25
作者简介:王瑞琪(1991-),男,硕士研究生,专业:动物学。E-mail:870831997@qq.com
基金资助:
[项目基金]国家自然科学基金项目(31500997);黑龙江省科技计划项目(PC13S04)

Differential Expression Analysis of miR-200b-3p and miR-200b-5p in Marek’s Disease Resistant and Susceptible SPF Chickens

WANG Rui-qi^1,2, LIAN Chuan-jiang², YI Cheng^1,2, HAN Ling-xia², YANG Chun-wen¹, CHEN Hong-yan²

1. College of Life Science and Technology, Mudanjiang Normal University, Mudanjiang 157011;
2. Division of Laboratory Animal and Comparative Medicine, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology/Heilongjiang Provincial Key Laboratory of Laboratory Animal and Comparative Medicine, Harbin Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences, Harbin 150069, China

Received:2016-11-23 Published:2017-06-25 Online:2017-06-25

摘要/Abstract

摘要： 目的在前期高通量测序分析的基础上,进一步利用荧光定量PCR验证miR-200b-3p和miR-200b-5p 在马立克氏病(MD)抗性(B21单倍型)与易感(B19单倍型)鸡法氏囊组织的差异表达情况。方法通过经优化后确定的最佳实时荧光定量PCR反应体系和扩增条件, 进行荧光定量PCR分析。结果 miR-200b-3p和miR-200b-5p荧光定量PCR结果与高通量测序结果上下调情况基本一致,但差异表达显著性分析结果却不完全相同。结论尽管差异表达显著性分析结果不完全一致,但两种方法的结果均提示来源于同一前体的miR-200b-3p和miR-200b-5p可能与MD抗性/易感性相关。

关键词: miR-200b, 马立克氏病(MD), 抗性/易感性, 高通量测序, 荧光定量PCR

Abstract: Objective To validate high throughput sequencing results by fluorescence quantitative PCR technique and analyze the expression of miR-200b-3p and miR-200b-5p in bursa, and explore possible molecular mechanism associated with Marek’s disease (MD) resistance/susceptibility. Methods Through optimization, the ideal amplification conditions and reaction system of real-time fluorescence quantitative PCR were identified. Results miR-200b-3p and miR-200b-5p fluorescence quantitative PCR results and high throughput sequencing results were consistent in down-regulation, but not significant difference. miR-200b-3p and miR-200b-5p two homologous miRNA showed similar expression after infected by Marek’s disease virus (MDV). Conclusion Although the difference is not consistent with the results of significant analysis, miR-200b-3p and miR-200b-5p may be associated with resistance / susceptibility of MD.

Key words: MiR-200b, Marek's disease (MD), Resistance/susceptibility, High throughput sequencing, Fluorescence quantitative PCR

中图分类号:

Q95-33

王瑞琪,廉传江,易诚,等. miR-200b-3p和miR-200b-5p在马立克氏病抗性与易感SPF鸡法氏囊组织的差异表达分析[J]. 实验动物与比较医学, 2017, 37(3): 244-248. DOI: 10.3969/j.issn.1674-5817.2017.03.015.

WANG Rui-qi,LIAN Chuan-jiang,YI Cheng,et al. Differential Expression Analysis of miR-200b-3p and miR-200b-5p in Marek’s Disease Resistant and Susceptible SPF Chickens[J]. Laboratory Animal and Comparative Medicine, 2017, 37(3): 244-248. DOI: 10.3969/j.issn.1674-5817.2017.03.015.

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miR-200b-3p和miR-200b-5p在马立克氏病抗性与易感SPF鸡法氏囊组织的差异表达分析

Differential Expression Analysis of miR-200b-3p and miR-200b-5p in Marek’s Disease Resistant and Susceptible SPF Chickens

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