1979年,上海市畜牧兽医学会成立“实验动物科学组”(即上海市实验动物学会的前身)。
1981年9月,上海畜牧兽医学会实验动物科学组创办《上海畜牧兽医通讯:实验动物科学专辑》,季刊,内部发行;成立编审组,由邓翀、王楠田、邱志方、舒家模、漆畹生和薛逸桢负责日常编审工作。
1984年1月,经上海市科委批准,更名为《上海实验动物科学》,并由上海市畜牧兽医学会实验动物研究会和上海实验动物研究中心(1984年初成立)共同主办,独立发行;同时,首届正式编委会成立,著名实验动物学专家邓翀担任主编。
1986年1月,正式挂靠上海实验动物研究中心,并组建编辑部。
1987年9月,经上海市新闻出版局批准,公开发行。
1988年1月,第二届编委会成立,主编为邓翀先生,名誉主编为遗传学家谈家桢院士。
1993年1月,第三届编委会成立,主编为刘瑞三教授,名誉主编为谈家桢院士。
1996、2004年,分别聘美国Harry Rozmiarek教授、英国Timothy H Morris教授担任名誉编委。
2003、2004年起,分别改为大16开、全铜版纸印刷。
2005年5月,经国家新闻出版总署批准,更名为《实验动物与比较医学》。
2005年,被美国《化学文摘》(Chemical Abstracts)收录。
2006年,录入“中国科技论文统计源期刊”,即“中国科技核心期刊”。
2008年起,改为双月刊,编辑部由上海市徐汇区迁至浦东新区张江科学城。
2010年1月,第四届编委会成立,主编为高诚研究员,名誉主编为刘瑞三教授等。
2012年,引进玛格泰克在线稿件处理系统,期刊投稿、审稿及修稿等开始数字化。
2014年12月,被国家新闻出版广电总局第一批认定为学术期刊。
2014、2018年1月,第五、第六届编委会成立,主编为高诚研究员。
2020年1月,建立期刊官网www.lacm.org.cn。
2020年11月,期刊官网升级,地址改为www.slarc.org.cn/dwyx。
2022年1月,第七届编委会成立,主编为王健研究员,名誉主编为李劲松院士,另设执行主编为吴宝金研究员。
2022年8月,被美国《乌利希国际期刊指南》(Ulrichsweb Global Serials Directory)收录。
2022年9月,被国际农业与生物科学研究中心文摘(CAB Abstracts)、全球健康数据库(Global Health)收录。
2022年10月,被哥白尼期刊数据库(ICI World of Journals)、哥白尼精选期刊数据库(ICI Master List)收录。
2022年10月,被瑞典开放获取期刊目录(DOAJ)收录。
2023年2月,被美国史蒂芬斯数据库(EBSCOhost)收录。
2023年8月,被WHO西太平洋地区医学索引(WPRIM)等数据库收录。