长爪沙鼠β-防御素基因的克隆与鉴定

›› 2008, Vol. 28 ›› Issue (4): 215-219.

长爪沙鼠β-防御素基因的克隆与鉴定

1.浙江省医学科学院，杭州 310013；2.浙江大学动物科学学院，杭州 310029

收稿日期:2008-06-05 出版日期:2008-04-30 发布日期:2008-04-30
基金资助:
浙江省医药卫生科学研究基金（编号 2005A002）

Clone and Identification of β-defensin Gene in Mongolian Gerbil

1. Zhejiang Academy of Medical Sciences, Hangzhou 310013, China;2. College of Animal Science, Zhejiang University, Hangzhou 310029，China

Received:2008-06-05 Online:2008-04-30 Published:2008-04-30

摘要/Abstract

摘要： 目的克隆长瓜沙鼠β-防御素基因序列，并对其进行鉴定及分析.方法从长爪沙鼠小肠中提取总RNA，根据GenBank中大、小鼠的β-防御素的基因序列，通过防御素基因的保守性设计引物，采用RT-PCR技术得到预期的PCR产物，将所得的片段进行克隆、测序，并应用相关生物信息学软件对序列进行鉴定和分析，序列提交genbank.结果 Blast比较发现，最终测序的结果与小鼠β-防御素-1和大鼠β-防御素-1的同源性均都大于78%，genbank登录号为EU784838.结论经测序鉴定证实该PCR产物为长爪沙鼠β-防御素基因1的一部分，且与大、小鼠的相应基因高度同源.

关键词: 长爪沙鼠, β-防御素, 克隆, 序列分析

Abstract: Objective To Clone p-defensin gene in Mongolian gerbil. Methods The primers was designed according to the published sequences in GenBank. A RT-PCR method was applied to clone the defens in beta 1 gene in small intestine of the Mongolian gerbil. The PCR products was sequenced and blasted with related sequences. Results The sequenced results presented that the product was highly identical to the defens in beta 1 gene in rat and mouse. The identification between the present sequence and that of rat or mouse was ranged from 85% to 78%，the GenBank Accession Number is EU784838. Conclusions The acquired sequence was a portion of defens in beta 1 gene, which presented highly identical to the same gene in rat and mouse.

Key words: Mongolian gerbil, β-defensin, Cloning, Sequence analysis, Identification

刘月环1，吴旧生2，施张奎1. 长爪沙鼠β-防御素基因的克隆与鉴定[J]. , 2008, 28(4): 215-219.

LIU Yue-huan1,WU Jiu-sheng2,SHI Zhang-Kui1. Clone and Identification of β-defensin Gene in Mongolian Gerbil[J]. , 2008, 28(4): 215-219.

[1]	王丹, 张晓璐, 王妍, 傅博, 王文栋, 刘京, 张甦寅, 武怡荷, 吴德国, 杜小燕, 战大伟, 章秀林, 李长龙. Big-BALB/c小鼠亚系选育前后的抗体制备效率比较研究[J]. 实验动物与比较医学, 2023, 43(6): 612-618.
[2]	卢领群, 郭红刚, 石巧娟, 戴方伟, 褚晓峰. 不同月龄长爪沙鼠的肾脏组织学特征[J]. 实验动物与比较医学, 2023, 43(1): 61-66.
[3]	李晓飞, 孙晓梅, 王文广, 匡德宣, 陆彩霞, 仝品芬, 罕园园, 李娜, 代解杰. 树鼩连接黏附分子A的基因克隆及初步功能研究#br#[J]. 实验动物与比较医学, 2020, 40(3): 196-.
[4]	王文广, 匡德宣, 李娜, 陆彩霞, 罕园园, 仝品芬, 孙晓梅, 代解杰. 树鼩Mfsd2a基因的克隆分析和不同组织表达量的检测[J]. 实验动物与比较医学, 2019, 39(3): 178-186.
[5]	王立娜, 陆勇, 孙强. 体细胞克隆猴与实验动物福利[J]. 实验动物与比较医学, 2018, 38(2): 83-85.
[6]	王志远, 刘月环. 长爪沙鼠肝脏基因组DNA甲基化水平检测[J]. 实验动物与比较医学, 2018, 38(1): 44-47.
[7]	李迎, 杜小燕, 崔晓霞, 马兰芝, 尚世臣, 何晓亚, 黄斌, 赵权, 李桂军, 王冬平, 陈振文. 长爪沙鼠近交系培育中血液生理生化指标的变化[J]. 实验动物与比较医学, 2018, 38(1): 48-53.
[8]	李迎, 杜小燕, 崔晓霞, 马兰芝, 尚世臣, 黄斌, 赵权, 李桂军, 王冬平, 陈振文. CMU/1和CMU/2长爪沙鼠繁殖性能与生长发育观测[J]. 实验动物与比较医学, 2018, 38(1): 54-56.
[9]	李迎, 杜小燕, 崔晓霞, 马兰芝, 尚世臣, 赵志兵, 赵权, 李桂军, 王冬平, 陈振文. CMU/1和CMU/2长爪沙鼠与F344大鼠及BALB/c小鼠4项凝血指标分析[J]. 实验动物与比较医学, 2018, 38(1): 57-59.
[10]	李迎, 陈振文, 马兰芝, 尚世臣, 尚玉璞, 赵权, 李桂军, 崔晓霞, 王冬平, 杜小燕. 近交系长爪沙鼠生化标记遗传监测方法的建立及其应用[J]. 实验动物与比较医学, 2017, 37(6): 442-447.
[11]	李迎, 崔晓霞, 杜小燕, 马兰芝, 尚世臣, 黄斌, 郭子潇, 赵权, 李桂军, 王冬平, 陈振文. 近交系CMU/1和CMU/2长爪沙鼠Willis环缺失与生理生化参数比较[J]. 实验动物与比较医学, 2017, 37(6): 470-474.
[12]	王存龙, 杜小燕, 刘欣, 郭萌, 吕建祎, 陈振文, 李长龙. 雌二醇诱导雄性长爪沙鼠乳腺增生模型的初探[J]. 实验动物与比较医学, 2017, 37(5): 352-356.
[13]	王菲菲, 龚菁菁, 霍学云, 路静, 郭萌, 刘欣, 李长龙, 杜小燕, 陈振文, 吕建祎. 自发性糖尿病长爪沙鼠环氧化酶(COX)-2在三种组织中的表达[J]. 实验动物与比较医学, 2017, 37(2): 118-122.
[14]	李银银, 龚菁菁, 吴绍亮, 李小红, 王存龙, 霍学云, 路静, 吕建祎, 刘欣, 郭萌, 李长龙, 陈振文, 杜小燕. ND3在自发性糖尿病长爪沙鼠5种组织中的表达[J]. 实验动物与比较医学, 2017, 37(1): 6-10.
[15]	卢孔杰, 徐婧雯, 张雪梅, 吴忠香, 任芳芳, 马娜, 巩蔚, 严丽蔚, 朱文兵, 董少忠. 树鼩CD4蛋白多克隆抗体的制备及检测[J]. 实验动物与比较医学, 2016, 36(4): 243-249.