《动物研究:体内实验报告》即ARRIVE 2.0指南的解释和阐述(四)
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Explanation and Elaboration for the ARRIVE Guidelines 2.0—Reporting Animal Research and In Vivo Experiments (Ⅳ)
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通讯作者: 韦玉生(1975—),男,博士,高级工程师,研究方向:实验动物医学。E-mail:yusheng.wei@pku.edu.cn。ORCID: 0009-0007-0479-9488;庞万勇(1974—),男,兽医学博士,研究方向:实验动物医学E-mail:pang1yong@outlook.com。ORCID: 0000-0002-0724-2016;陶雨风(1970—),女,博士,高级工程师,研究方向:分子免疫学。E-mail:taoyf@cnas.org.cn。ORCID: 0000-0003-1925-1048;
本文编辑: 张俊彦
收稿日期: 2023-10-13 修回日期: 2023-12-05
基金资助: |
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Corresponding authors: WEI Yusheng (ORCID: 0009-0007-0479-9488), E-mail:yusheng.wei@pku.edu.cn;PANG Wanyong (ORCID: 0000-0002-0724-2016), E-mail:pang1yong@outlook.com;TAO Yufeng (ORCID: 0000-0003-1925-1048), E-mail:taoyf@cnas.org.cn;
Received: 2023-10-13 Revised: 2023-12-05
作者简介 About authors




提高生物医学研究结果的可重复性是一项重大挑战,研究人员透明且准确地报告其研究过程有利于读者对该研究结果的可靠性进行评估,进而重复该实验或在该成果的基础上进一步探索。ARRIVE 2.0指南是英国国家3Rs中心(NC3Rs)于2019年组织发布的一份适用于任何与活体动物研究报告相关的指导性清单,用以提高动物体内实验设计、实验实施和实验报告的规范性,以及动物实验结果的可靠性、可重复性和临床转化率。ARRIVE 2.0指南的使用不仅可以丰富动物实验研究报告的细节,确保动物实验结果信息被充分评估和利用,还可以使读者准确且清晰地了解作者所表述的内容,促进基础研究评审过程的透明化和完整性。本文是在国际期刊遵循ARRIVE 2.0指南的最佳实践基础上,对2020 年发表于PLoS Biology期刊上的ARRIVE 2.0指南完整解读版(
关键词:
Improving the reproducibility of biomedical research results is a major challenge.Transparent and accurate reporting of the research process enables readers to evaluate the reliability of the research results and further explore the experiment by repeating it or building upon its findings. The ARRIVE 2.0 guidelines, released in 2019 by the UK National Centre for the Replacement, Refinement and Reduction of Animals in Research (NC3Rs), provide a checklist applicable to any in vivo animal research report. These guidelines aim to improve the standardization of experimental design, implementation, and reporting, as well as the reliability, repeatability, and clinical translatability of animal experimental results. The use of ARRIVE 2.0 guidelines not only enriches the details of animal experimental research reports, ensuring that information on animal experimental results is fully evaluated and utilized, but also enables readers to understand the content expressed by the author accurately and clearly, promoting the transparency and integrity of the fundamental research review process. At present, the ARRIVE 2.0 guidelines have been widely adopted by international biomedical journals. This article is a Chinese translation based on the best practices of international journals following the ARRIVE 2.0 guidelines in international journals, specifically for the complete interpretation of the ARRIVE 2.0 guidelines published in the PLoS Biology journal in 2020 (original text can be found at
Keywords:
本文引用格式
李夏莹, 田永路, 刘晓宇, 卢选成, 陈国元, 卢晓, 白玉, 高静, 李垚, 韦玉生, 庞万勇, 陶雨风.
LI Xiaying, TIAN Yonglu, LIU Xiaoyu, LU Xuancheng, CHEN Guoyuan, LU Xiao, BAI Yu, GAO Jing, LI Yao, WEI Yusheng, PANG Wanyong, TAO Yufeng.
PLoS Biology期刊于2020年发表了ARRIVE 2.0指南即《动物研究:体内实验报告》完整解读版(原文请见
2 ARRIVE 2.0指南的“推荐11条”
2.1 条目11:摘要
提供包括研究目标、动物种类及品系和性别、关键方法、主要发现和研究结论的准确摘要。
解释:准确的摘要可增加文章的实用性和影响力,并使读者能够评估研究的可靠性[156]。摘要通常被读者用作筛选工具,以决定是否阅读全文或是否将一篇文章纳入系统综述。然而,很多摘要往往没能包含足够的信息[157],或者包含了与文章其他部分不一致的信息[158-159]。进行系统综述时,相关论文的初始筛选是基于标题、摘要和关键词[160]。如果摘要中忽略诸如所用动物种类或所测试药物等信息,会因为无法被识别而限制了其被纳入相关研究及临床前系统综述的价值。例如,在整理MVA85A疫苗对动物结核病攻毒效果的系统综述过程中,一篇最大的临床前试验文章并未被纳入,因为其摘要或关键词中没有提及疫苗名称,直到该领域专家讨论后才被纳入系统综述[161]。
为了最大限度地发挥摘要的作用,摘要应包括以下信息:所用动物的物种、品系、性别,研究的方法、结果和结论,还应描述研究的目标,即它是为了验证一个特定的假设还是为了产生一个新的假设(具体请见条目13:研究目标)。摘要信息全面,可以使读者能够更好地理解研究结果的可靠性,并了解该研究如何在更广的范围内应用。
报告示例1:“背景和目的:哮喘是一种涉及气道高反应性和气道重构的炎性疾病。黄酮类化合物具有抗炎和抗氧化活性,可能是哮喘的潜在治疗药物。本研究目的是评估樱花素(sakuranetin)在实验性哮喘模型小鼠中的治疗效果。实验方法:雄性BALB/c小鼠在第0天和第14天腹腔注射卵清蛋白,并在第24、26和28天时吸入1%的雾化卵清蛋白。从第24天至第29天,卵清蛋白致敏的动物每天接受溶剂(生理盐水和DMSO)、樱花素(每只小鼠20 mg/kg)或地塞米松(每只小鼠5 mg/kg)处理。对照组接受生理盐水和滴鼻溶剂处理。第29天,测定小鼠的气道高反应性、炎症和结构重塑情况以及特异性IgE抗体水平,并用Bioplex试剂盒检测肺匀浆中趋化因子RANTES、IL-5、IL-4、嗜酸性粒细胞趋化蛋白(eotaxin)、IL-10、TNF-α、IFN-γ和粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GMC-SF)的含量,用免疫组织化学法观察炎性细胞中8种异丙肾上腺素和NF-κB的激活情况。关键结果:实验结果显示,樱花素治疗可减轻动物的气道高反应性、炎症和重构,这些作用可归因于Th2促炎细胞因子和氧化应激减少以及NF-κB活化调控。结论和启示:这些结果强调了黄酮类化合物在该哮喘模型小鼠中对抗氧化应激的重要性,并表明樱花素是治疗哮喘的潜在候选药物。”[162]
报告示例2:“在世界上的某些地区,实验猪(Sus scrofa)通常被单独饲养在无菌设施中,这可能给动物带来应激。本研究目标是确定单笼饲养和丰富环境对饲养在PigTurn(一种具有自动血液采样的新型圈养系统)中实验猪的影响,并探索将泪痕作为一种新的动物福利指标的可行性。将20头约克夏猪×长白猪杂交获得的离乳仔猪随机分为4个处理组(E-I、E-NI、NE-I和NE-NI),采用2×2析因设计即丰富环境[分为非丰富环境(NE)和丰富环境(E)两种]和隔离饲养[分为视觉分离(I)和非视觉分离(NI,即能够看到另一头猪但不能互动)两种]的组合。首先对实验猪行插管术,并在操作恢复后48 h将其放入PigTurns中。每天两次自动采集动物血液,测定白细胞分类计数和皮质醇水平。每天拍摄眼部照片,并使用0~5评分表和Image-J软件对泪痕进行量化,以测量其面积和周长。对动物行为进行视频记录和扫描采样,以确定不同行为的时间分配。使用SAS软件的MIXED程序对数据进行REML分析。结果显示环境丰富会增加动物站立和侧卧的时间比值,并降低血浆中皮质醇水平以及泪痕的面积和周长。对隔离饲养的实验猪加以环境丰富并不影响其血浆皮质醇水平,但非视觉分离大大降低了皮质醇水平。与其他3种处理相比,NE+I组(无环境丰富+视觉隔离组)的泪痕面积和周长最高。嗜酸性粒细胞的数目在E+NI组(环境丰富+非视觉隔离组)中最高,在NE+I组(无环境丰富+视觉隔离组)中最低。缺乏环境丰富措施并与同类动物隔离饲养的组合最大限度地影响了泪痕和嗜酸性粒细胞数量。适当的环境丰富加上能接近别的猪可能会改善实验猪福利。”[163]
2.2 条目12:研究背景
2.2.1 子条目12a:包括足够的科学背景信息,以帮助读者更好理解研究的基本原理和背景,并解释实验方案
研究背景部分应描述该研究的基本原理和背景,以及与其他研究的关系,包括先前工作的相关文献。同时应概述支持假设或目标的证据,解释为什么本实验方法最适合回答研究问题。
报告示例1:“几十年来,心血管疾病一直是全球居民死亡首因。......心血管相关的研究大多使用健康、年轻、没有疾病的动物模型进行。最近,在健康动物模型中取得成功的心脏保护疗法,应用于胰岛素抵抗肥胖症、糖尿病、代谢综合征和衰老的动物时却相继失败,凸显出开发代表人类临床状况的疾病动物模型的必要性。......目前大多数探究心血管疾病和缺血再灌注(I-R)心肌耐受性的实验室研究是使用正常性状模型,该模型合并通过基因或饮食诱导的肥胖和代谢综合征。临床上,老年男性患者经常会同时出现睾酮缺乏和代谢综合征.......代谢综合征和睾酮缺乏之间存在着紧密而复杂的联系,可能对心血管疾病产生显著影响,而目前的模型尚未能解决这一问题。......尽管实验室研究通常依赖于单一的代谢综合征或性腺功能减退动物模型,但鉴于它们在临床实践中的相互影响,有必要开发合适的代谢综合征合并性腺功能减退动物模型,特别是在心血管疾病研究领域。”[167]
2.2.2 子条目12b:解释所使用的动物品种和模型如何实现科学目标,以及与人类生物学的相关性(如适用)
解释:研究背景部分应提供足够的细节,以便于读者评估用于解决研究问题的动物模型的适用性。这些细节包括选择特定物种的原因,并解释评估的结果指标如何与正在研究的条件相关,以及动物模型是如何验证的。也可以指出某个常用的动物模型在该领域中并不适用,并且应提供一个经过充分考虑的详细理由。
报告示例2:“为了达到研究目的,我们选择了一种毛果芸香碱(pilocarpine)诱导的癫痫模型,其特征是大脑损伤后强烈、频繁的自发癫痫发作,......有明显的行为异常,......以及对抗癫痫药物不敏感。.......这些特征涵盖了人类颞叶癫痫的几个关键特征,而颞叶癫痫是成年人最常见的癫痫类型。”[170]
报告示例3:“健康造血干细胞(HSC)移植是治疗各种恶性血液病和非恶性疾病以及免疫功能障碍的关键疗法。......斑马鱼已经被确定为研究造血系统的成功模型,与哺乳动物具有显著的同源性。......斑马鱼透明胚胎的成像是一个有力的工具,对于证实斑马鱼尾部造血组织(CHT)与哺乳动物胎儿造血生态位相当非常重要。.......斑马鱼胚胎中异种移植揭示了斑马鱼和哺乳动物之间高度保守的机制。最近,小鼠骨髓细胞被成功移植到斑马鱼胚胎中,揭示了斑马鱼和哺乳动物之间高度保守的造血机制。.......此外,将CD34富集的人类细胞移植到斑马鱼体内,发现其定位在斑马鱼的CHT,且可以对斑马鱼基质细胞衍生因子产生反应。”[171]
2.3 条目13:研究目的
清楚地描述研究问题、研究目的,以及要验证的具体假设(如适用)。
解释:这部分应通过描述研究所涉及的问题来解释本研究的目的,使读者可以确定该研究是否与他们相关。读者还可以评估模型生物、研究程序、测量结果和分析方法的相关性。
为了理解一项研究,了解其是探索性的还是检验某一假设至关重要。一项典型的探索性研究可以测量多个结局指标,并寻找可用于产生假设的数据模式或关系。它也可能是一项初步研究,旨在为后续更大规模实验的设计或可行性提供信息。探索性研究可帮助研究人员选择后续研究中应关注的变量或结局指标,进而设计假设验证实验。
相比之下,探索性研究涵盖了许多可能的效应,可能会得到更多的假阳性结果,因为有些结果是偶然的阳性结果。因此,精心设计的假设检验研究的结果比探索性或描述性研究的结果更可靠。此外,独立重复实验和Meta分析(又称荟萃分析)可以进一步提高研究结论的可信度。
应清楚地概述研究目标,包括它是假设检验还是探索性研究,或者是否包括这两种类型。假设检验研究可以收集额外的信息用于探索性目的。区分哪些假设是预先指定的,哪些是在数据检查后产生的,这非常重要,尤其是在报告不属于原始研究设计的非预期效应或结果时。
报告示例1:“本研究的主要目的是观察注射到同种异体受体[6-羟基多巴胺(6-OHDA)-半损伤大鼠,一种帕金森病(PD)动物模型]纹状体中的间充质干细胞(MSC)的细胞免疫反应,次要目的是确定这些细胞在动物体内预防黑质纹状体多巴胺耗竭和相关运动缺陷的能力[174]。”
报告示例2:“在这项探索性研究中,我们旨在研究钙电穿孔是否能引发类似于电化学疗法的抗癌免疫反应。为此,我们给患有CT26结肠肿瘤的免疫功能正常的BALB/c小鼠施予钙电穿孔、电化学疗法或基于超声的钙或博来霉素输入处理。”[175]
报告示例3:“在表征rab-6.2缺失的秀丽隐杆线虫的另一项研究中,我们观察到rab-6.2(ok2254)线虫皮肤是脆弱的,因此开始从基因上分析rab-6.2(ok2254)线虫的脆弱皮肤表型。......结果发现,在正常饲养过程中rab-6.2(ok2254)线虫培养板上有几条皮肤破裂的线虫,这在野生型线虫的培养物中很少观察到。......我们推测RAB-6.2蛋白是皮肤完整性所必需的。”[176]
2.4 条目14:伦理声明
提供批准在本研究中使用动物的伦理审查委员会或同等机构的名称,以及任何相关许可证或方案的编号(如适用)。如果没有申请或未获得伦理批准,须提供理由。
解释:作者有责任遵守与科学使用动物有关的法规和指南,包括确保在研究工作开始之前获得伦理委员会和/或监管机构的批准。伦理声明为编辑、审稿人和读者提供了该研究已受到伦理监督的保证[177],这也提高了关于研究中使用动物的透明度和理解,并促进了公众信任。
部分应提供一份明确的说明,解释该研究是如何遵循适当的法规和指南。包括批准该研究的机构名称和审查该研究的伦理委员会名称[例如,美国的实验动物管理和使用委员会(IACUC)或英国的动物福利和伦理审查机构(AWERB)],并注明方案或项目许可证编号以便查询。还可增加任何相关的认可,例如国际实验动物评估和认可委员会(AAALAC)[178]或良好实验室规范(GLP,即药物非临床研究质量管理规范)。
如果某一研究不受任何法规涵盖,不需要正式的伦理批准(例如,使用不受法规或法律保护的动物物种的研究),则应证明该研究符合国际标准,并引用适当的参考文献。并且需要提供一份明确的声明,解释为什么该研究免于监管批准。
报告示例1:“所有程序均遵照1986年《英国动物(科学程序)法》[United Kingdom Animal (Scientific Procedures) Act 1986]进行,并经机构伦理审查委员会(Alderley公园动物福利和伦理审查委员会以及Babraham研究所动物福利和伦理审查委员会)批准,并在项目许可证的授权下进行(编号分别为40/3729和70/8307)。”[179]
报告示例2:“本研究中的所有方案均经北京协和医学院阜外医院动物实验伦理委员会和北京实验动物管理委员会批准(IACUC许可证号:FW2010-101523),符合美国国立卫生研究院(NIH)出版的《实验动物管理和使用指南》(NIH出版物编号85-23,1996年修订)的规定。”[180]
报告示例3:“样本和数据是根据法国动物选择研究所(ISA)方案在ISA员工的监督下进行收集。这部分样本和数据是作为荷兰蛋鸡商业育种计划中常规动物数据采集的一部分。针对ISA的繁殖核心群进行收集的样本和数据仅用于育种目的,是一种非实验性农业实践,受《动物法》和《皇家程序令》监管。而《荷兰动物实验法》并不适用于非实验性农业实践。因此,本研究不需要声明动物实验委员会进行伦理审查。为了本研究目的,采集样本时没有引起额外的动物不适。”[181]
2.5 条目15:饲养场所和饲养
提供动物饲养场所和饲养条件的详细信息,包括环境丰富改善措施。
表3 报告饲养场所和饲养条件及其对实验动物的影响时需要考虑的信息示例
Table 3
编号No. | 报告信息 Information to report | 影响实验动物的示例 Examples of effects on laboratory animals |
---|---|---|
1 | 笼/箱/饲养系统(类型和尺寸) | 影响行为[182]和恐惧学习[183];水箱颜色影响水生物种的应激[184-185] |
2 | 食物和水(类型、成分、供应商和获取途径) | 影响体重、肿瘤发展、肾病严重程度[186]和出现帕金森病症状的阈值[187];母本的饮食会影响后代的体重[188] |
3 | 垫料和筑巢材料 | 影响对应激[189]和疼痛[190]的行为反应 |
4 | 温度和湿度 | 改变肿瘤发展进展[191];调节斑马鱼的性别分化[192] |
5 | 卫生(笼具更换/水箱换水频率、材料转移、水质) | 影响血压、心率和行为[193];增加一个额外的变异源[194-195] |
6 | 社会环境(群体规模和组成/饲养密度) | 损害动物福利[196];诱发攻击性行为[197-198]和应激[185] |
7 | 生物安全(级别) | 动物的微生物状态会导致系统性疾病参数的变化[199] |
8 | 照明(类型、时间表和强度) | 改变免疫和应激反应[200] |
9 | 环境丰富 | 减少焦虑[201-202]、应激[201-202]和异常重复行为[203-205];降低癫痫[206]和骨关节炎[207]的易感性,并改变神经系统疾病的病理学[208];增加鱼类的觅食行为[209] |
10 | 实验动物的性别 | 影响生理应激和疼痛行为[210] |
如果版面有限,可以公共存储库中信息链接的形式或作为补充信息,提供相关的居住空间和饲养条件的详细说明。
报告示例1:“繁殖群体被饲养在独立笼盒(IVC,意大利Tecniplast)中,温度为20~24 ˚C,相对湿度为50%~60%,笼内每小时进行60次换气,并在早上5:30开灯的情况下进行12 h/12 h的光/暗循环。从离乳开始,最大饲养密度为来自同一窝性别相同的5只小鼠。提供云杉木屑(Lignocel FS-14,德国J.Rettenmaier & Soehne GmbH公司)作为垫料。给小鼠喂食标准化的小鼠饲料(1314,德国Altromin公司),并提供自由饮水。所有材料(包括IVC、盖子、食盒、水瓶、垫料和水)在使用前都经过高压灭菌。根据我们的健康监测诊断实验室(德国mfd Diagnostics GmbH实验室)的检测结果,欧洲实验动物科学协会联合会(FELASA)规定的需排除的所有病原在哨兵鼠中检测均呈阴性。”[217]
报告示例2:“同一性别的同窝小鼠饲养在IVC里,每笼2只或4只。所有小鼠都保持在有规律的昼夜光照周期(12 h光照∶12 h暗照),自由采食(7012 Harlan Teklad LM-485小鼠/大鼠可消毒饮食)和饮水。垫料为玉米芯。丰富环境包括筑巢材料(Nestlets,美国Ancare公司)、PVC管道和庇护所(Refuge XKA-2450-087,加拿大Ketchum Manufacturing股份有限公司)。SPF级小鼠饲养在屏障设施中,该设施位于经AAALAC认可的康奈尔大学转基因小鼠核心实验室。”[218]
(未完待续)
作者贡献声明
李夏莹负责ARRIVE 2.0指南完整版第四部分即“推荐11条”中第11~15条内容的编译初稿和修改,为第一作者;
田永路参与ARRIVE 2.0指南完整版“推荐11条”中第11~15条内容的编译初稿写作;
陈国元、卢晓和白玉负责对ARRIVE 2.0指南完整版中文编译内容提出关键性修改建议;
高静负责ARRIVE 2.0指南完整版中统计学概念及阐述的翻译审定;
李垚负责ARRIVE 2.0指南完整版中文编译工作的策划、组织,以及提出关键性修改建议;
陶雨风负责对ARRIVE 2.0指南完整版“推荐11条”中第11~15条编译内容提出关键性修改建议,并提供基金支持;
庞万勇负责ARRIVE 2.0指南完整版中文编译工作的指导,以及全部内容的审定;
韦玉生参与ARRIVE 2.0指南完整版“推荐11条”中第11~15条内容的编译初稿写作和修订。
利益冲突声明
本文所有作者均声明不存在利益冲突。
参考文献
«动物研究:体内实验报告»即 ARRIVE 2.0 指南的解释和阐述(一)
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Explanation and elaboration for the ARRIVE Guidelines 2.0—reporting animal research and in vivo experiments ( Ⅰ)
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«动物研究:体内实验报告»即 ARRIVE 2.0 指南的解释和阐述(二)
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Explanation and elaboration of the ARRIVE guidelines 2.0—reporting animal research and in vivo experiments ( Ⅱ)
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«动物研究:体内实验报告»即 ARRIVE 2.0指南的解释与阐述(三)
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