Laboratory Animal and Comparative Medicine
• XXXX XXXX •
BU Jiwen1(
)(
), HUA Ye2, JIN Shirong2, REN Ningxin1, LI Funing1, DU Jiulin1
Online:2026-03-04
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BU Jiwen
CLC Number:
BU Jiwen,HUA Ye,JIN Shirong,et al. Automated Management of Zebrafish Strains and Its Facilities[J]. Laboratory Animal and Comparative Medicine. DOI: 10.12300/j.issn.1674-5817.2025.136.
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URL: https://www.slarc.org.cn/dwyx/EN/10.12300/j.issn.1674-5817.2025.136
Figure 3 Zoned operational diagram of the digital zebrafish room
信息类别 Information Category | 核心内容 Core Content | 查看与录入 View and Enter | 各模块关联整合情况 Inter-module Connectivity and Integration | 自动统计功能 Auto-statistics Function |
|---|---|---|---|---|
鱼群基本信息 Basic Information of the Fish Stock | 品系/Sock唯一编号、出生日期、传代人、负责人、鱼总数、鱼缸位置、父母本信息等 | 查看方式: 1)Stock板块搜索; 2)线下扫描鱼缸二维码; 3)3D数字鱼房点击鱼缸; 录入方式: 1)Stock板块“新建”; 2)Stock板块“复制”; 3)3D数字鱼房点击鱼缸“新建” | 1)关联品系信息,可一键导入基本信息; 2)关联“3D数字鱼房”:3D快速定位查找鱼群; 3)关联“精子数据库”:进行精子冻存、取用操作; 4)关联“死鱼/病鱼记录”:自动更新鱼群数量; 5)关联“谱系树” | 根据死鱼/病鱼记录,自动核减鱼群中鱼的数量 |
鱼群使用记录 Fish Stock Operation Records | 使用人、使用时间、用途、交配对象等历史记录 | 查看方式: 1)Stock板块搜索; 2)线下扫描鱼缸二维码; 3)3D数字鱼房点击鱼缸; 录入方式: 1)线下扫描鱼缸二维码; 2)3D数字鱼房点击鱼缸; | 关联“3D数字鱼房:3D快速定位查找鱼群 | 自动统计鱼群累计使用频次,以数据决策繁殖计划,优化种群数量 |
健康事件记录 Health Event Record | 死鱼记录:时间、数量、症状 病鱼记录:时间、数量、症状 | 查看方式: 1)Stock,Founder板块搜索; 2)线下扫描鱼缸二维码; 3)3D数字鱼房点击鱼缸; 录入方式: 1)线下扫描鱼缸二维码; 2)3D数字鱼房点击鱼缸 | 1)关联“3D数字鱼房”:3D快速定位查找鱼群; 2)关联“事件”板块,可查看整个鱼房各循环系统死鱼/病鱼总体情况 | 实时汇总,可按照年/月/系统时时查询死鱼/病鱼数量和比例统计图 |
鱼群预定 Fish Stock order | 申请人、用途、所需数量、需用日期 | 查看方式: 3D数字鱼房鱼缸上显示; 录入方式: 3D数字鱼房点击鱼缸 | 关联“数字鱼房”:3D快速定位查看 | 自动与使用记录联动,自动检测鱼群使用情况 |
鱼群谱系树 Fish Stock Family Tree | 父本、母本及后代的血缘关系图谱(谱系树) | 查看方式: “谱系树”板块,根据位置、鱼系名称搜索查看; 交互操作: 点击谱系树中任意节点鱼群、生成该鱼群的谱系树 | 关联“3D数字鱼房”:3D快速定位查找鱼群 | 便于研究其遗传背景、种质和谱系关系 |
Table 1 Stock database and its module integration
信息类别 Information Category | 核心内容 Core Content | 查看与录入 View and Enter | 各模块关联整合情况 Inter-module Connectivity and Integration | 自动统计功能 Auto-statistics Function |
|---|---|---|---|---|
鱼群基本信息 Basic Information of the Fish Stock | 品系/Sock唯一编号、出生日期、传代人、负责人、鱼总数、鱼缸位置、父母本信息等 | 查看方式: 1)Stock板块搜索; 2)线下扫描鱼缸二维码; 3)3D数字鱼房点击鱼缸; 录入方式: 1)Stock板块“新建”; 2)Stock板块“复制”; 3)3D数字鱼房点击鱼缸“新建” | 1)关联品系信息,可一键导入基本信息; 2)关联“3D数字鱼房”:3D快速定位查找鱼群; 3)关联“精子数据库”:进行精子冻存、取用操作; 4)关联“死鱼/病鱼记录”:自动更新鱼群数量; 5)关联“谱系树” | 根据死鱼/病鱼记录,自动核减鱼群中鱼的数量 |
鱼群使用记录 Fish Stock Operation Records | 使用人、使用时间、用途、交配对象等历史记录 | 查看方式: 1)Stock板块搜索; 2)线下扫描鱼缸二维码; 3)3D数字鱼房点击鱼缸; 录入方式: 1)线下扫描鱼缸二维码; 2)3D数字鱼房点击鱼缸; | 关联“3D数字鱼房:3D快速定位查找鱼群 | 自动统计鱼群累计使用频次,以数据决策繁殖计划,优化种群数量 |
健康事件记录 Health Event Record | 死鱼记录:时间、数量、症状 病鱼记录:时间、数量、症状 | 查看方式: 1)Stock,Founder板块搜索; 2)线下扫描鱼缸二维码; 3)3D数字鱼房点击鱼缸; 录入方式: 1)线下扫描鱼缸二维码; 2)3D数字鱼房点击鱼缸 | 1)关联“3D数字鱼房”:3D快速定位查找鱼群; 2)关联“事件”板块,可查看整个鱼房各循环系统死鱼/病鱼总体情况 | 实时汇总,可按照年/月/系统时时查询死鱼/病鱼数量和比例统计图 |
鱼群预定 Fish Stock order | 申请人、用途、所需数量、需用日期 | 查看方式: 3D数字鱼房鱼缸上显示; 录入方式: 3D数字鱼房点击鱼缸 | 关联“数字鱼房”:3D快速定位查看 | 自动与使用记录联动,自动检测鱼群使用情况 |
鱼群谱系树 Fish Stock Family Tree | 父本、母本及后代的血缘关系图谱(谱系树) | 查看方式: “谱系树”板块,根据位置、鱼系名称搜索查看; 交互操作: 点击谱系树中任意节点鱼群、生成该鱼群的谱系树 | 关联“3D数字鱼房”:3D快速定位查找鱼群 | 便于研究其遗传背景、种质和谱系关系 |
指令大类 Major Categories of Commands | 指令小类 Sub-categories of Commands | 监测目标 Monitoring Target | 预警触发条件 Alert Trigger Conditions | 系统响应与操作 System Response and Actions | 执行要求与流程 System Execution Requirements and Procedures |
|---|---|---|---|---|---|
资源库监控指令 Resource Repository Monitoring Command | 质粒库监控 | 质粒库存量 | < 5 µL | 自动发送预警提醒 | 需及时补充库存,系统追踪补充进度,直至恢复安全库存。 |
| 精子库监控 | 品系冻存精子总数 | < 3 管 | 自动发送预警提醒 | 需立即进行精子采集与冻存,系统追踪补充进度,直至恢复安全库存。 | |
| 鱼群库监控 | 同一品系下活体鱼总数及月龄 | 鱼总数< 10条,或所有月龄 ≥ 14月 | 自动发送传代繁殖指令,挂载传代电子标签 | 需立即启动繁殖计划,系统追踪进度,直至恢复安全水平 | |
信息录入规范指令 Data Entry Standardization Command | 新建品系 | 自构建品系 | 构建品系用质粒未入库 | 系统提示无法创建新品系 | 需提前将该质粒录入质粒库 |
| 外部引入品系(已发表) | 未上传参考文献 | 系统提示无法创建新品系 | 需完善论文发表信息 | ||
| 新建鱼群 | 新建鱼群所属的品系 | 没有建立品系; 未填父母本信息 | 系统提示品系未建立; 系统提示父母本信息缺失 | 需提前创建品系 需选择父母本 | |
| 新建质粒 | 质粒信息 | 已发表质粒缺失参考文献 | 系统提示无参考文献无法新建质粒 | 需补充文献信息 | |
交配用鱼指导指令 mating Fish Command | 交配间隔 | 品系交配记录 | 交配间隔 < 7天 | 系统禁止使用,提示繁殖间隔不足 | 需等待≥7天后才可再次交配 |
| 定期训鱼 | 品系交配记录 | 3–4个月内无交配使用记录 | 自动发送训鱼指令 | 需完成训鱼并提交使用记录 | |
品系传代指令 Fish Line Propagation Command | 常规传代 | 品系最年轻鱼群月龄 | ≥14月龄 | 自动发送传代指令,挂载传代电子标签 | 30日内完成新增鱼群登记,系统每日监测进度直至完成 |
| 应急传代 | 新引入或濒危品系 | 由管理员手动启动 | 挂载传代电子标签 | 30日内完成新增鱼群登记,系统每日监测进度直至完成 | |
空间轮转指令 Space Rotation Command | 小鱼属性鱼架 | 小鱼月龄 | ≥ 2月龄 | 自动发送挪缸指令,挂载挪缸电子标签 | 5天内挪至普通鱼架,按成鱼方案喂养 |
| 筛鱼小缸鱼架 | 单条鱼放置时长 | 放置时间≥ 10天 | 自动发送挪缸指令,挂载“挪缸”电子标签 | 14天内完成筛选,严禁长时间占用筛鱼小缸 |
Table 2 Management commands set
指令大类 Major Categories of Commands | 指令小类 Sub-categories of Commands | 监测目标 Monitoring Target | 预警触发条件 Alert Trigger Conditions | 系统响应与操作 System Response and Actions | 执行要求与流程 System Execution Requirements and Procedures |
|---|---|---|---|---|---|
资源库监控指令 Resource Repository Monitoring Command | 质粒库监控 | 质粒库存量 | < 5 µL | 自动发送预警提醒 | 需及时补充库存,系统追踪补充进度,直至恢复安全库存。 |
| 精子库监控 | 品系冻存精子总数 | < 3 管 | 自动发送预警提醒 | 需立即进行精子采集与冻存,系统追踪补充进度,直至恢复安全库存。 | |
| 鱼群库监控 | 同一品系下活体鱼总数及月龄 | 鱼总数< 10条,或所有月龄 ≥ 14月 | 自动发送传代繁殖指令,挂载传代电子标签 | 需立即启动繁殖计划,系统追踪进度,直至恢复安全水平 | |
信息录入规范指令 Data Entry Standardization Command | 新建品系 | 自构建品系 | 构建品系用质粒未入库 | 系统提示无法创建新品系 | 需提前将该质粒录入质粒库 |
| 外部引入品系(已发表) | 未上传参考文献 | 系统提示无法创建新品系 | 需完善论文发表信息 | ||
| 新建鱼群 | 新建鱼群所属的品系 | 没有建立品系; 未填父母本信息 | 系统提示品系未建立; 系统提示父母本信息缺失 | 需提前创建品系 需选择父母本 | |
| 新建质粒 | 质粒信息 | 已发表质粒缺失参考文献 | 系统提示无参考文献无法新建质粒 | 需补充文献信息 | |
交配用鱼指导指令 mating Fish Command | 交配间隔 | 品系交配记录 | 交配间隔 < 7天 | 系统禁止使用,提示繁殖间隔不足 | 需等待≥7天后才可再次交配 |
| 定期训鱼 | 品系交配记录 | 3–4个月内无交配使用记录 | 自动发送训鱼指令 | 需完成训鱼并提交使用记录 | |
品系传代指令 Fish Line Propagation Command | 常规传代 | 品系最年轻鱼群月龄 | ≥14月龄 | 自动发送传代指令,挂载传代电子标签 | 30日内完成新增鱼群登记,系统每日监测进度直至完成 |
| 应急传代 | 新引入或濒危品系 | 由管理员手动启动 | 挂载传代电子标签 | 30日内完成新增鱼群登记,系统每日监测进度直至完成 | |
空间轮转指令 Space Rotation Command | 小鱼属性鱼架 | 小鱼月龄 | ≥ 2月龄 | 自动发送挪缸指令,挂载挪缸电子标签 | 5天内挪至普通鱼架,按成鱼方案喂养 |
| 筛鱼小缸鱼架 | 单条鱼放置时长 | 放置时间≥ 10天 | 自动发送挪缸指令,挂载“挪缸”电子标签 | 14天内完成筛选,严禁长时间占用筛鱼小缸 |
Figure 5 Aquaculture Recirculating System Monitoring
维度 Category | 评估问题描述 Assessment Item | 平均分 Mean | 标准差 SD |
|---|---|---|---|
数据系统性和完整性维度 Data Systematicity and Integrity Dimension | ·数据录入完整性:系统的强制填写项保证了记录数据的完整性。 | 4.79 | 0.42 |
| ·数据录入规范性:系统的标准化选项保证了数据录入的规范性。 | 4.89 | 0.31 | |
| ·数据录入准确性:系统关键字段的“一键导入”功能避免了手动输入的多样性,确保数据准确。 | 4.86 | 0.36 | |
| ·数据可追溯性:系统中每个品系和每缸鱼都建立了完整的“终身档案”,可随时查看全部历史记录。 | 4.89 | 0.31 | |
效率维度 Efficiency Dimension | ·数据录入效率:系统关键字段“一键导入”和“一键操作”等功能减少了手动输入的时间,操作简易直观,极大提高了效率。 | 4.86 | 0.36 |
| ·数据查询效率:所有功能模块深度互相关联,可任意点快速导航至相关信息。 | 4.86 | 0.36 | |
| ·库存盘点和计划效率:所有鱼系、质粒、精子库存和数量动态自动统计,进行全资源盘点可以减少人力投入,帮助我更容易地制定和跟踪品系的繁殖计划。 | 4.71 | 0.53 | |
| ·现场效率:可以在鱼房工作现场使用手持设备完成信息的查询和录入。 | 4.68 | 0.61 | |
安全和稳定性维度 Safety and Stability Dimension | ·实时预警:系统的预警功能(如“需要传代”、“小鱼需要挪缸”、“需要定期训鱼”,“需要清理”,“精子库存不足”等)能及时、有效地提醒我避免出现潜在问题和失误,保障资源安全。 | 4.46 | 0.69 |
| ·预见性决策:系统自动统计循环系统 pH参数,电导参数,水压参数,温度等详情,可以时时观测变化曲线,支持我做出了更好的日常管理决策,确保养殖系统稳定。 | 4.89 | 0.31 | |
整体印象与接受度 Overall Satisfaction | ·整体效率:总体而言,该系统提高了我在鱼房工作的效率。 | 4.89 | 0.31 |
| ·整体信任:我信任该系统中所记录数据的准确性。 | 4.75 | 0.44 | |
| ·整体满意:总的来说,我对使用该系统的体验感到满意。 | 4.86 | 0.36 | |
| ·整体推荐:我会毫不犹豫地向其他斑马鱼研究人员推荐该系统。 | 4.89 | 0.32 |
Table3 Survey Questionnaire: User Satisfaction with the Fish Room and Strain Management System
维度 Category | 评估问题描述 Assessment Item | 平均分 Mean | 标准差 SD |
|---|---|---|---|
数据系统性和完整性维度 Data Systematicity and Integrity Dimension | ·数据录入完整性:系统的强制填写项保证了记录数据的完整性。 | 4.79 | 0.42 |
| ·数据录入规范性:系统的标准化选项保证了数据录入的规范性。 | 4.89 | 0.31 | |
| ·数据录入准确性:系统关键字段的“一键导入”功能避免了手动输入的多样性,确保数据准确。 | 4.86 | 0.36 | |
| ·数据可追溯性:系统中每个品系和每缸鱼都建立了完整的“终身档案”,可随时查看全部历史记录。 | 4.89 | 0.31 | |
效率维度 Efficiency Dimension | ·数据录入效率:系统关键字段“一键导入”和“一键操作”等功能减少了手动输入的时间,操作简易直观,极大提高了效率。 | 4.86 | 0.36 |
| ·数据查询效率:所有功能模块深度互相关联,可任意点快速导航至相关信息。 | 4.86 | 0.36 | |
| ·库存盘点和计划效率:所有鱼系、质粒、精子库存和数量动态自动统计,进行全资源盘点可以减少人力投入,帮助我更容易地制定和跟踪品系的繁殖计划。 | 4.71 | 0.53 | |
| ·现场效率:可以在鱼房工作现场使用手持设备完成信息的查询和录入。 | 4.68 | 0.61 | |
安全和稳定性维度 Safety and Stability Dimension | ·实时预警:系统的预警功能(如“需要传代”、“小鱼需要挪缸”、“需要定期训鱼”,“需要清理”,“精子库存不足”等)能及时、有效地提醒我避免出现潜在问题和失误,保障资源安全。 | 4.46 | 0.69 |
| ·预见性决策:系统自动统计循环系统 pH参数,电导参数,水压参数,温度等详情,可以时时观测变化曲线,支持我做出了更好的日常管理决策,确保养殖系统稳定。 | 4.89 | 0.31 | |
整体印象与接受度 Overall Satisfaction | ·整体效率:总体而言,该系统提高了我在鱼房工作的效率。 | 4.89 | 0.31 |
| ·整体信任:我信任该系统中所记录数据的准确性。 | 4.75 | 0.44 | |
| ·整体满意:总的来说,我对使用该系统的体验感到满意。 | 4.86 | 0.36 | |
| ·整体推荐:我会毫不犹豫地向其他斑马鱼研究人员推荐该系统。 | 4.89 | 0.32 |
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