基于团体标准T/CALAS 21—2017的Wistar大鼠微卫星DNA群体遗传质量分析

doi:10.12300/j.issn.1674-5817.2021.073

实验动物与比较医学 ›› 2021, Vol. 41 ›› Issue (6): 528-534.DOI: 10.12300/j.issn.1674-5817.2021.073

基于团体标准T/CALAS 21—2017的Wistar大鼠微卫星DNA群体遗传质量分析

魏杰^*, 左琴^*, 王洪, 李欢, 周佳琪, 光姣娜, 范涛, 刘佐民, 付瑞, 岳秉飞

中国食品药品检定研究院, 北京 102629

收稿日期:2021-04-01 修回日期:2021-07-22 出版日期:2021-12-25 发布日期:2021-12-29
作者简介:魏杰(1982—), 女, 副研究员, 硕士, 研究方向: 免疫遗传检测。E-mail: jane3040320@163.com;左琴(1975—), 女, 副研究员, 硕士, 研究方向: 实验动物遗传与保种。E-mail: zuoqin2001@163.com ^*两位为共同第一作者

Population Genetic Quality Analysis of Microsatellite DNA in Wistar Rats Based on T/CALAS 21—2017

WEI Jie^*, ZUO Qin^*, WANG Hong, LI Huan, ZHOU Jiaqi, GUANG Jiaona, FAN Tao, LIU Zuomin, FU Rui, YUE Bingfei

National Institutes for Food and Drug Control, Beijing 102629, China

Received:2021-04-01 Revised:2021-07-22 Online:2021-12-25 Published:2021-12-29
About author:^*WEI Jie and ZUO Qin contributed equally to this work.

摘要/Abstract

摘要： 目的利用团体标准T/CALAS 21—2017推荐的方法对不同时期封闭群Wistar大鼠的遗传质量进行分析,同时进行团体标准T/CALAS 21—2017的适用性评价。方法 2015年、2019年选测的Wistar大鼠分别命名为A组和B组。按团体标准T/CALAS 21—2017要求,使用25对微卫星引物获取两组封闭群Wistar大鼠的遗传参数进行质量分析,利用多态性信息含量（polymorphism information content,PIC）分析位点多态性。结果 A组和B组大鼠中分别检测到100个和69个等位基因。两群体平均杂合度分别为0.574和0.447,平均PIC分别为0.541和0.393。结论团体标准T/CALAS 21—2017在封闭群大鼠遗传质量分析中具有良好的适用性,A组Wistar大鼠的遗传多样性优于B组。

关键词: Wistar大鼠, T/CALAS 21-2017, 封闭群, 微卫星DNA, 遗传多样性

Abstract: Objective To analyze the genetic quality of an outbred stock of Wistar rats in different periods by T/CALAS 21—2017 method, and to evaluate the applicability of the association standard. Methods Wistar rats selected from the same outbred stock in 2015 and 2019 were named as group A and group B, respectively. Twenty-five pairs of microsatellite primers were used to get genetic parameters for quality analysis of the outbred stock Wistar rats according to the association standard T/CALAS 21—2017. Polymorphism information content (PIC) was used to analyze the polymorphism of the loci. Results One hundred alleles in group A and 69 alleles in group B were obtained. The average heterozygosity of the two groups was 0.574 and 0.447, while the average PIC was 0.541 and 0.393, respectively. Conclusion The association standard T/CALAS 21—2017 has good applicability in the genetic quality analysis of outbred stock rats, and the genetic diversity of group A is better than that of group B.

Key words: Wistar rats, T/CALAS 21—2017, Outbred stock, Microsatellite DNA, Genetic diversity

中图分类号:

Q95-33
R-332

魏杰, 左琴, 王洪, 李欢, 周佳琪, 光姣娜, 范涛, 刘佐民, 付瑞, 岳秉飞. 基于团体标准T/CALAS 21—2017的Wistar大鼠微卫星DNA群体遗传质量分析[J]. 实验动物与比较医学, 2021, 41(6): 528-534.

WEI Jie, ZUO Qin, WANG Hong, LI Huan, ZHOU Jiaqi, GUANG Jiaona, FAN Tao, LIU Zuomin, FU Rui, YUE Bingfei. Population Genetic Quality Analysis of Microsatellite DNA in Wistar Rats Based on T/CALAS 21—2017[J]. Laboratory Animal and Comparative Medicine, 2021, 41(6): 528-534.

图/表 2

参考文献

[1] NATARAJU G J, RANVIR R K, KOTHULE V R, et al.Spontaneous lesions in endocrine glands of experimental Wistar rats and beagle dogs[J]. Exp Toxicol Pathol, 2016, 68(1):1-13. DOI:10.1016/j.etp.2015.09.002.
[2] AFZAL S M, VAFA A, RASHID S, et al.Amelioration of N, N'-dimethylhydrazine induced colon toxicity by epigallocatechin gallate in Wistar rats[J]. Hum Exp Toxicol, 2021, 40(9):1558-1571. DOI:10.1177/09603271211002884.
[3] IKEWUCHI J C, IKEWUCHI C C, IFEANACHO M O, et al.Attenuation of doxorubicin-induced cardiotoxicity in Wistar rats by aqueous leaf-extracts of Chromolaena odorata and Tridax procumbens[J]. J Ethnopharmacol, 2021, 274:114004. DOI:10.1016/j.jep.2021.114004.
[4] TOMONARI Y, SATO J, KUROTAKI T, et al.Thymomas and associated hyperplastic lesions in wistar hannover rats[J]. Toxicol Pathol, 2019, 47(2):129-137. DOI:10.1177/0192623318822301.
[5] DYRSKOG S E, GREGERSEN S, HERMANSEN K.High-fat feeding during gestation and nursing period have differential effects on the insulin secretory capacity in offspring from normal Wistar rats[J]. Rev Diabet Stud, 2005, 2(3):136-145. DOI:10.1900/rds.2005.2.136.
[6] SILA A, GHLISSI Z, KAMOUN Z, et al.Astaxanthin from shrimp by-products ameliorates nephropathy in diabetic rats[J]. Eur J Nutr, 2015, 54(2):301-307. DOI:10.1007/s00394-014-0711-2.
[7] NAAIJKENS B A, VAN DIJK A, MEINSTER E, et al.Wistar rats from different suppliers have a different response in an acute myocardial infarction model[J]. Res Vet Sci, 2014, 96(2):377-379. DOI:10.1016/j.rvsc.2013.12.015.
[8] 周玮. 封闭群实验动物的遗传学质量控制[J]. 上海实验动物科学, 1997, 17(1):46-49.
[9] 陈振文,李瑞生,王承利, 等. 用DNA指纹图技术分析Wistar大鼠的遗传距离[J]. 遗传, 2002, 24(3):275-278.
[10] 李瑞生, 张巧云, 董罡, 等. 封闭群Wistar大鼠的微卫星DNA遗传监测分析[J]. 动物医学进展, 2005, 26(10):78-82. DOI:10.16437/j.cnki.1007-5038.2005. 10.018.
[11] NAKANISHI S, SERIKAWA T, KURAMOTO T.Slc: Wistar outbred rats show close genetic similarity with F344 inbred rats[J]. Exp Anim, 2015, 64(1):25-29. DOI:10.1538/expanim.14-0051.
[12] 中国实验动物学会. 实验动物小鼠、大鼠微卫星DNA 标记检测方法: T/CALAS 21—2017[S]. 北京: 中国科技出版传媒集团有限公司, 2017.
[13] SAMBROOK J, RUSSELL D.Molecular cloning: a laboratory manual[M]. Vol 2. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001.
[14] 吴艳花, 徐玲玲, 杜小燕, 等. 封闭群实验用小型猪遗传标准的建立[J]. 实验动物科学, 2010, 27(6):33-38. DOI:10.3969/j.issn.1006-6179.2010.06.010.
[15] 魏杰, 王洪, 于鹏丽, 等. DB11/T828.3—2011中12号染色体标记筛选及适用性评价研究[J]. 中国实验动物医学, 2017, 27(7):59-63. DOI:10.3969.j.issn.1671-7856.2017.07.011.
[16] BOTSTEIN D, WHITE R L, SKOLNICK M, et al.Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms[J]. Am J Hum Genet, 1980, 32(3):314-331.
[17] 国家标准化管理委员会, 国家质量监督检验检疫总局. 实验动物哺乳类实验动物的遗传质量控制: GB 14923—2010[S]. 北京: 中国质量标准出版传媒有限公司, 2010.
[18] 王洪, 魏杰, 冯育芳, 等. 实验小鼠、大鼠微卫星DNA检测法标准的编制[J]. 中国比较医学杂志, 2019, 29(9):97-102. DOI:10.3969/j.issn.1671-7856.2019.09.015.
[19] 朱斌. 我国团体标准的发展现状[J]. 中国标准化, 2020(2):61-64. DOI:10.3969/j.issn.1002-5944.2020.02.004.
[20] 北京市市场监督管理局. 实验动物繁育与遗传监测: DB11/T 1804—2020[S]. 2020.

基于团体标准T/CALAS 21—2017的Wistar大鼠微卫星DNA群体遗传质量分析

Population Genetic Quality Analysis of Microsatellite DNA in Wistar Rats Based on T/CALAS 21—2017

RichHTML

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

图/表 2

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	侯敏博, 崔甜甜, 苏娜瑛, 张苗苗, 焦永敏, 严建燕, 汪溪洁, 大平东子. 一例Han-Wistar大鼠垂体细胞瘤的病理学分析[J]. 实验动物与比较医学, 2023, 43(6): 654-658.
[2]	许冰馨, 范凯健, 王婷玉, 陈慧瑾. 地塞米松对胶原诱导性关节炎大鼠模型软骨退化的改善作用[J]. 实验动物与比较医学, 2022, 42(5): 416-422.
[3]	吕晓君, 吴森, 张菊, 徐小玲, 潘望平, 李厚钢, 王平慧, 何开勇. 用高热量饲料建立大鼠肥胖模型的实验研究[J]. 实验动物与比较医学, 2020, 40(5): 374-.
[4]	杨健莉, 王猛, 李兆阳, 郑志红. 哺乳仔鼠数量控制对KM小鼠生长发育和繁殖性能影响初探[J]. 实验动物与比较医学, 2018, 38(3): 239-241.
[5]	刘城秀, 李娜, 仝品芬, 王文广, 陆彩霞, 罕园园, 匡德宣, 孙晓梅, 代解杰. 封闭群树鼩的微卫星遗传特性分析[J]. 实验动物与比较医学, 2018, 38(1): 1-9.
[6]	洪杨, 袁明铭, 周静, 张磊, 董涵. 应用微卫星标记对两个SD大鼠封闭群的遗传分析[J]. 实验动物与比较医学, 2018, 38(1): 10-15.
[7]	周建华, 李志雄, 杨燕燕, 谢金东, 俞春英, 王训立. 应用微卫星DNA标记对福建亚种猕猴遗传多样性的分析[J]. 实验动物与比较医学, 2017, 37(6): 434-441.
[8]	陈明飞, 姚刚, 赵海, 钱宁, 吴曙光. 贵州小型猪母猪初产繁殖性状及其相关和通径分析[J]. 实验动物与比较医学, 2017, 37(4): 324-327.
[9]	丁广宇, 潘绵立, 胡寒, 刘艺, 沈龙海. 三种饲料建立大鼠缺铁性贫血模型的比较[J]. 实验动物与比较医学, 2016, 36(6): 433-436.
[10]	肖成荣, 谭洪玲, 马增春, 王宇光, 王德文, 孙敬翔, 高月. 老年Wistar大鼠自发性肿瘤及血液生化检测[J]. 实验动物与比较医学, 2014, 34(4): 324-329.
[11]	申幸娇, 岳秉飞, 马丽颖. 三个封闭群实验兔线粒体DNA D-loop区多态性分析[J]. 实验动物与比较医学, 2014, 34(1): 29-34.
[12]	王希龙, 闵凡贵, 潘金春, 袁文, 陈瑞爱, 黄保松, 王凤国. 实验用五指山小型猪选育[J]. 实验动物与比较医学, 2011, 31(5): 345-348.
[13]	闵凡贵, 潘金春, 袁文, 陈瑞爱, 王凤国, 王希龙. 五指山小型猪繁殖性能测定[J]. 实验动物与比较医学, 2011, 31(5): 349-351.
[14]	恽时锋，张立波，董敏，赵志刚，许龙详，陈莉，刘彪，吴正林，田小芸，周森妹，郭联庆. 新西兰白兔血液流变学特性动态变化[J]. , 2010, 30(5): 379-380.
[15]	朱亮，应华忠，陈民利，蔡月琴，余佳，肖慧，陶涛，潘永明. 微卫星标记对封闭群和近交第五代WHBE兔的遗传分析[J]. , 2009, 29(5): 334-340.